Согласно Приказу № 00447 из 65 950 человек 10 000, подлежащих расстрелу, должны были происходить из лагерей, при этом, например, квота из 5 000 приходилась на Московскую область, а квота из 6 000 приходилась на Западную и Восточную Сибирь (5 000 и 1 000, соответственно) — самые высокие квоты по СССР в ходе этой карательной операции. При этом Ежов уточнял:
«В случаях, когда обстановка будет требовать увеличения утвержденных цифр, наркомы республиканских НКВД и начальники краевых и областных управлений НКВД обязаны представлять мне соответствующие мотивированные ходатайства. Уменьшение цифр, а равно и перевод лиц, намеченных к репрессированию по первой категории, во вторую категорию и наоборот — разрешается.»
То есть увеличивать общие квоты было невозможно без визы Ежова, но было возможно «переливать» жертвы из одного сосуда в другой по решению наместников по принципу известного лингвистического примера про проставление запятой во фразе «казнить нельзя помиловать». Своим распоряжением № 791 от 22 сентября 1937 г. Ежов приказал пересмотреть все ранее вынесенные приговоры и впредь направлять всех осуждаемых по II категории в ИТЛ вместо тюрем, этим самым разгружая тюрьмы и повышая эффективность системы за счет трудовой эксплуатации людей в лагерном производстве.
В соответствии с обстановкой и местными условиями территория республики, края и области должны были делиться на оперативные сектора. Для организации и проведения операции по каждому сектору должны формироваться оперативные группы, возглавляемые ответственными работниками НКВД республики, краевого или областного Управления НКВД, способными успешно справиться с возлагаемыми на них серьезными (дословно) оперативными задачами. Оперативные группы должны были комплектоваться необходимым количеством оперативных работников и средствами транспорта и связи. Войсковые или милицейские подразделения также предусматривались в подмогу, если это было необходимо по оперативной обстановке. На начальников оперативных групп возлагалось руководство учетом и выявлением подлежащих репрессированию, руководство следствием, утверждение обвинительных заключений и приведение приговоров троек в исполнение. Контроль за исполнением приговоров был возложен на руководителей 8-го отдела краевого или областного управлений НКВД, нередко лично участвовавших в казнях. Кроме того, Приказ не ограничивал исполнителей от увеличения квот под расстрел в лагерях за счет общереспубликанских квот на расстрел.
Иными словами, сколько угодно из 5 000 жертв ВМН могли оказаться зеками ИТЛ и приплюсовывались к тем, что и так в ИТЛ подлежали расстрелу. Ведь совершенно очевидно, что выбрать жертв из зеков в лагерях было гораздо проще и быстрее, чем охотиться за «контрой» силами оперативников, проводя обыски, аресты, дознания и допросы, составляя акты, описи, организуя охранительные мероприятия и делопроизводство.
Операцией руководил Николай Иванович Ежов, пришедший на смену казненного и проклятого матерью Генриху Ягоде, при непосредственном общем руководстве своего заместителя — Начальника Главного управления государственной безопасности — Комкора Михаила Петровича Фриновского . Высылались квоты на каждый регион, согласно которым, как скот на закланье, истреблялись люди. Было организовано 64 тройки , состав которых в том же Приказе утвердил Ежов. Далее в Приказе Ежов повторяет мысль, констатированную им ранее в том же приказе:
«Тройки, в зависимости от характера материалов и степени социальной опасности арестованного, могут относить лиц, намеченных к репрессированию по второй категории, к первой категории и лиц, намеченных к репрессированию по первой категории, ко второй».
Приговоры по I категории надлежало приводить в исполнение в местах и порядке, указанными наркомами внутренних дел, начальниками управления и областных отделов НКВД с обязательным полным сохранением в тайне времени и места приведения приговора в исполнение — дословно.